本試劑盒適用于提取糞便樣本中RNA。試劑盒由高效吸附核酸的超順磁性納米微球和安全環保的提取試劑體系組成:經過獨特的表面修飾的磁珠,結合核酸能力更強、洗脫更容易;操作步驟簡單,操作時間短,可在室溫下完成整個提取過程,適合于快速核酸提取的磁珠自動化過程。
操作流程(示意圖):
磁珠法糞便RNA提取試劑盒在提取糞便RNA的應用實例見下。
目錄號 | 規格 | 適用機型 |
---|---|---|
RE12001 | 20份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
RE12002 | 100份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
RE1296B | 96份 | 醫脈賽、圓點、奧盛、天隆、天根等品牌多種純化機型 |
RE1260C | 60份 | Thermo Scientific KingFisher mL磁珠提取儀 |
RE1296D | 96份 | Thermo Scientific KingFisher Flex純化系統 |
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【手工提取步驟】
1. 取100-200mg的糞便樣本于2ml含玻璃珠及組織消化液的研磨離心管中 (若糞便樣本為液態,取200μl于離心管中),使用四維旋轉混勻儀漩渦混勻(40Hz,240s)【糞便
樣本病毒RNA提取: 取50-100mg的糞便樣本于2ml離心管(若糞便樣本為液態,取200μl于離心管中), 加入400ul組織消化液,使用漩渦儀混勻1min】
2. 上述樣本3000g,離心5min,上清液為預處理后提取樣本;
3. 取離心后上清液200μl,加入600μl 裂解吸附液,15μl磁珠,置于旋轉混和儀,溫和混勻15min ;
4. 用磁分離架吸附磁珠,棄上清;
5. 加入600μl洗滌液I洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;
6. 加入600μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;
7. 加入600μl洗滌液III洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;
8. 再次加入600μl洗滌液III洗滌磁珠1min;
9. 吸附磁珠,棄上清后靜置3-5min,去除乙醇殘留;
10. 加入50μl洗脫液,溫和混勻,洗脫5min;
11. 磁場吸附磁珠,回收含核酸洗脫液至另一RNase-free離心管內,用于后續檢測或-20°C儲存。
【自動化提取步驟(以32通道為例)】
1. RE1296B預裝板設置(96孔深孔板,樣品量200μl,16通量)
2. 從試劑盒中取出預分裝96深孔板,輕甩96深孔板使試劑及磁珠均集中到96深孔板底部。使用前小心撕去鋁箔封口膜,避免96深孔板振動,防止液體濺出(注意:室溫低
于15°C時,請在開封使用前將96孔板置于37°C預熱20min,以避免沉淀析出);
3. 在第1列、第7列溶液中加入200μl預處理后的樣本(見實驗步驟1-2);
4. 放置2個8道磁套;選擇附表所列的自動化提取程序,開始提??;客戶可按所使用的核酸自動提取儀適當調整程序,如果有問題,請聯系技術支持。
5. 轉移第6列、第12列中含核酸的洗脫液至RNase-free離心管內,用于后續檢測或-20°C儲存。
次序 | 列號 | 程序 | 混合時間(sec.) | 磁吸時間(sec.) | 等待時間(sec.) | 體積(μl) | 混合速度 | 溫度(℃) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 裂解 | 300 | 0 | 0 | 800 | 快 | 37 |
2 | 2 | 吸磁 | 30 | 20 | 0 | 600 | 快 | 室溫 |
3 | 1 | 結合 | 600 | 20 | 0 | 800 | 快 | 37 |
4 | 2 | 洗滌1 | 120 | 20 | 0 | 600 | 快 | 室溫 |
5 | 3 | 洗滌2 | 60 | 20 | 0 | 600 | 快 | 室溫 |
6 | 4 | 洗滌3 | 60 | 30 | 0 | 600 | 快 | 室溫 |
7 | 5 | 洗滌4 | 60 | 30 | 120 | 600 | 快 | 室溫 |
8 | 6 | 洗脫 | 300 | 60 | 0 | 50 | 快 | 50 |
9 | 4 | 移去磁珠 | 30 | 0 | 0 | 600 | 快 | 室溫 |
A. 糞便RNA得率低
1.取樣前樣品沒有充分研磨。糞便樣品取樣前將樣品充分研磨。
2.磁珠加樣量不足。請在吸取磁珠前將核酸提取磁珠懸液充分混勻。
3.與磁珠結合不充分。在RNA與磁珠結合過程中請溫和搖勻,確保RNA與磁珠充分結合。
4.樣品沒有按照要求保存導致RNA降解。
B. 獲得的RNA條帶彌散,RNA片段斷裂
1. 樣品冷藏時間過久,沒有按照要求冷凍保存。請使用新鮮及正確保藏的樣品。
2. 操作過程過于劇烈,RNA被機械打斷。請嚴格按照說明書操作。
C. RNA樣品不純,抑制或者干擾后續試驗
1. 樣本裂解結合后沒有進行磁珠轉移更換離心管,導致管壁黏附的雜質污染最終提取物。
2. 磁珠沒有完全干燥,有乙醇殘留。最后一次洗滌后盡量吸凈離心管內的液體。
3. 加入洗脫液之前將磁珠靜置5min左右,確保乙醇完全揮發。