磁珠法石蠟包埋樣品DNA提取試劑盒
分類:石蠟包埋樣本DNA提取目錄:DE02
產品特性:
保護操作人員健康,環境安全 |
高通量:快速完成石蠟包埋樣本DNA提取 |
增強腫瘤和其他疾病診斷和靶向治療準確性 |
高效去交聯效果 |
自動化適用 |
本試劑盒用于石蠟包埋組織中基因組DNA的提取。試劑盒不使用二甲苯作為石蠟溶劑,從而增加操作人員和環境的安全性;經過獨特的表面修飾的磁珠,結合核酸能力更強,洗脫更容易;操作步驟簡單,適合于基因組DNA的磁珠自動化提取過程。本試劑盒純化的DNA可直接用于各種下游操作,包括PCR、文庫構建、測序分析等。
操作流程(示意圖):
磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒在腫瘤病人FFPE樣本提取核酸的應用實例、與國際金標準試劑盒比較和通過石蠟包埋樣本所提取的gDNA的real-time PCR實驗驗證提取效果的實例見下。
醫脈賽(EmerTher)磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒在腫瘤病人FFPE樣本提取核酸的應用實例。
1.樣本
四名腫瘤病人FFPE樣本(3片10μm厚的石蠟切片組織樣本/每人)
2.試劑
Emerther磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒
3.核酸提取方法
EmerTher磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒,用自動核酸提取儀提取
A、 脫蠟
1. 溶解蛋白酶K:按標簽所示,吸取PK溶解液至蛋白酶K干粉中配制成蛋白酶K溶液20mg/ml,顛倒混勻數次讓蛋白酶K充分溶解;
2. 取一定量石蠟包埋組織(如1-5片10μm厚的石蠟切片組織樣本),轉移至1.5ml離心管中;
3. 加入300μl石蠟樣本液,150μl ATL和20μl蛋白酶K溶液,置于56°C 恒溫水浴鍋孵育1hr ,期間混勻3-5次。也可消化過夜;
B、消化
4. 在組織樣本中加入150μl石蠟消化液,置于85°C恒溫水浴鍋孵育30min;
C、 DNA提取
5. 15000g離心5min;
6. 小心吸取全部下層液體,加入375μl裂解吸附液、30μl核酸提取磁珠,置于旋轉混合儀,溫和混勻20min;
7. 用磁分離架吸附磁珠1min,棄上清;
8. 加入700μl洗滌液I洗滌磁珠,顛倒混勻洗滌1min,吸附磁珠,棄上清;
9. 再次加入700μl洗滌液I洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;
10. 加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;
11. 再次加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠;
12. 盡量吸棄上清后靜置5min,去除乙醇殘留;
13. 加入100μl洗脫液,50°C混合均勻洗脫5min;
14. 磁場吸附磁珠,回收含基因組DNA的洗脫液至另一干凈離心管內;
15. 用于后續檢測或-20℃儲存。
4.結果:提取的DNA產量高、純度高,方便進行下一步的PCR擴增。
磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒與目前市場上國際金標準試劑盒的比較。
磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒所提取gDNA的real-time PCR實驗,用以驗證醫脈賽(Emerther)磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取效果。(石蠟包埋樣本編號:1603089)
實驗結論
包埋樣本DNA提取試劑盒從5片石蠟樣本切片中大約可以提取4微克genomic DNA。用所得gDNA做GAPDH的real-time PCR獲得曲線較好,
且提取所得DNA的OD值(260/280)分別為1.81,1.90,說明所得DNA質量良好。由于該DAN提取試劑盒所提取的DNA量較多,且質量良好,證明試劑盒效果良好。
目錄號 | 規格 | 適用機型 |
---|---|---|
DE02001 | 20份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE02002 | 100份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE0296B | 96份 | 醫脈賽、圓點、奧盛、天隆、天根等品牌多種純化機型 |
DE0260C | 60份 | Thermo Scientific KingFisher mL磁珠提取儀 |
DE0296D | 96份 | Thermo Scientific KingFisher Flex純化系統 |
我們提供了多種訂購渠道和訂購方式:
1.直接電話聯系我們:400-880-7356;021-60556823
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【手動提取步驟】
A、 脫蠟
1. 溶解蛋白酶K:按標簽所示,吸取PK溶解液至蛋白酶K干粉中配制成蛋白酶K溶液20mg/ml,顛倒混勻數次讓蛋白酶K充分溶解;
2. 取一定量石蠟包埋組織(如1-5片10μm厚的石蠟切片組織樣本),轉移至1.5ml離心管中;
3. 加入300μl石蠟樣本液,150μlATL和20μl蛋白酶K,置于56°C 恒溫水浴鍋孵育1hr,期間混勻3-5次。也可消化過夜;
B、消化
4. 在組織樣本中加入150μl石蠟消化液,置于85oC恒溫水浴鍋孵育30min;
C、DNA提取
5. 15000g離心5min;
6. 小心吸取全部下層液體,加入375μl裂解吸附液、30μl核酸提取磁珠,置于旋轉混合儀,溫和混勻20min;
7. 用磁分離架吸附磁珠1min,棄上清;
8. 加入700μl洗滌液I洗滌磁珠,顛倒混勻洗滌1min,吸附磁珠,棄上清;
9. 再次加入700μl洗滌液I洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;
10. 加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;
11. 再次加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠;
12. 盡量吸棄上清后靜置5min,去除乙醇殘留;
13. 加入100μl洗脫液,50°C混合均勻洗脫5min;
14. 磁場吸附磁珠,回收含基因組DNA的洗脫液至另一干凈離心管內;
15. 用于后續檢測或-20℃儲存。
【自動化提取步驟(以32通道為例)】
1.DE0296B預裝板設置(96空深孔板,樣品量:15000g離心后取全部下層液體,16通量)
2.從試劑盒中取出預分裝96深孔板,輕甩96深孔板使試劑及磁珠均集中到96深孔板底部。使用前小心撕去鋁箔封口膜,避免96深孔板振動,防止液體濺出(注意:室溫低于
15℃時,請在開封使用前將96孔板置于37℃預熱20min,以避免沉淀析出);
3.在第1列、第7列中加入脫蠟消化后的全部樣本(下層液體);
4.放置2個8道磁套;根據附表所列的自動化提取程序,開始提??;客戶可按所使用的核酸自動提取儀適當調整程序,如果有問題,請聯系技術支持;
5.轉移第6列、第12列中含核酸的洗脫液,用于后續檢測或-20℃儲存。
步驟 | 空位 | 名稱 | 混合時間 (sec.) | 磁吸時間 (sec.) | 等待時間 (sec.) | 容積 (μl) | 混合速度 | 溫度(℃) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 裂解 | 600 | 0 | 0 | 700 | 快 | 37 |
2 | 2 | 吸磁 | 30 | 30 | 0 | 750 | 中 | 室溫 |
3 | 1 | 結合 | 300 | 30 | 0 | 700 | 快 | 37 |
4 | 2 | 洗滌1 | 120 | 20 | 0 | 700 | 快 | 室溫 |
5 | 3 | 洗滌2 | 120 | 20 | 0 | 700 | 快 | 室溫 |
6 | 4 | 洗滌3 | 120 | 20 | 0 | 700 | 快 | 室溫 |
7 | 5 | 洗滌4 | 120 | 30 | 120 | 700 | 快 | 室溫 |
8 | 6 | 洗脫 | 300 | 60 | 0 | 100 | 中 | 50 |
9 | 4 | 移去磁珠 | 30 | 0 | 0 | 700 | 快 | 室溫 |
1、試劑中是否還有有毒試劑?
我們的試劑不含有二甲苯等有毒試劑,可以在保護實驗室操作人的安全下快速方便的進行提取。
2、過夜消化與消化3h的差異?
過夜消化的提取效果更好,但是要是時間緊迫,3h消化液足以滿足實驗要求。