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磁珠法石蠟包埋樣品DNA提取試劑盒

分類:石蠟包埋樣本DNA提取目錄:DE02

產品特性:

保護操作人員健康,環境安全
高通量:快速完成石蠟包埋樣本DNA提取
增強腫瘤和其他疾病診斷和靶向治療準確性
高效去交聯效果
自動化適用


本試劑盒用于石蠟包埋組織中基因組DNA的提取。試劑盒不使用二甲苯作為石蠟溶劑,從而增加操作人員和環境的安全性;經過獨特的表面修飾的磁珠,結合核酸能力更強,洗脫更容易;操作步驟簡單,適合于基因組DNA的磁珠自動化提取過程。本試劑盒純化的DNA可直接用于各種下游操作,包括PCR、文庫構建、測序分析等。

操作流程(示意圖):





磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒在腫瘤病人FFPE樣本提取核酸的應用實例、與國際金標準試劑盒比較和通過石蠟包埋樣本所提取的gDNA的real-time PCR實驗驗證提取效果的實例見下。

醫脈賽(EmerTher)磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒在腫瘤病人FFPE樣本提取核酸的應用實例。
1.樣本
四名腫瘤病人FFPE樣本(3片10μm厚的石蠟切片組織樣本/每人)

2.試劑
Emerther磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒

3.核酸提取方法
EmerTher磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒,用自動核酸提取儀提取

A、 脫蠟

1. 溶解蛋白酶K:按標簽所示,吸取PK溶解液至蛋白酶K干粉中配制成蛋白酶K溶液20mg/ml,顛倒混勻數次讓蛋白酶K充分溶解;

2. 取一定量石蠟包埋組織(如1-5片10μm厚的石蠟切片組織樣本),轉移至1.5ml離心管中;

3. 加入300μl石蠟樣本液,150μl ATL和20μl蛋白酶K溶液,置于56°C 恒溫水浴鍋孵育1hr ,期間混勻3-5次。也可消化過夜;


B、消化

4. 在組織樣本中加入150μl石蠟消化液,置于85°C恒溫水浴鍋孵育30min;


C、 DNA提取

5. 15000g離心5min;

6. 小心吸取全部下層液體,加入375μl裂解吸附液、30μl核酸提取磁珠,置于旋轉混合儀,溫和混勻20min;

7. 用磁分離架吸附磁珠1min,棄上清;

8. 加入700μl洗滌液I洗滌磁珠,顛倒混勻洗滌1min,吸附磁珠,棄上清;

9. 再次加入700μl洗滌液I洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;

10. 加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;

11. 再次加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠;

12. 盡量吸棄上清后靜置5min,去除乙醇殘留;

13. 加入100μl洗脫液,50°C混合均勻洗脫5min;

14. 磁場吸附磁珠,回收含基因組DNA的洗脫液至另一干凈離心管內;

15. 用于后續檢測或-20℃儲存。

4.結果:提取的DNA產量高、純度高,方便進行下一步的PCR擴增。




磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒與目前市場上國際金標準試劑盒的比較。




磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取試劑盒所提取gDNA的real-time PCR實驗,用以驗證醫脈賽(Emerther)磁珠法石蠟包埋樣本DNA提取效果。(石蠟包埋樣本編號:1603089)

實驗結論

包埋樣本DNA提取試劑盒從5片石蠟樣本切片中大約可以提取4微克genomic DNA。用所得gDNA做GAPDH的real-time PCR獲得曲線較好,

且提取所得DNA的OD值(260/280)分別為1.81,1.90,說明所得DNA質量良好。由于該DAN提取試劑盒所提取的DNA量較多,且質量良好,證明試劑盒效果良好。








目錄號規格適用機型 
DE0200120份瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站
DE02002100份瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站
DE0296B96份醫脈賽、圓點、奧盛、天隆、天根等品牌多種純化機型
DE0260C60份Thermo Scientific KingFisher mL磁珠提取儀
DE0296D96份Thermo Scientific KingFisher Flex純化系統


我們提供了多種訂購渠道和訂購方式:
1.直接電話聯系我們:400-880-7356;021-60556823
2.直接郵箱聯系我們:order@emerther.cn
3.直接點擊“在線預訂”,即可跳轉第三方頁面,按照第三方頁面流程點擊“立即訂購”即可(具體操作可參考以下視圖)。





【手動提取步驟】

A、 脫蠟

1. 溶解蛋白酶K:按標簽所示,吸取PK溶解液至蛋白酶K干粉中配制成蛋白酶K溶液20mg/ml,顛倒混勻數次讓蛋白酶K充分溶解;

2. 取一定量石蠟包埋組織(如1-5片10μm厚的石蠟切片組織樣本),轉移至1.5ml離心管中;

3. 加入300μl石蠟樣本液,150μlATL和20μl蛋白酶K,置于56°C 恒溫水浴鍋孵育1hr,期間混勻3-5次。也可消化過夜;


B、消化

4. 在組織樣本中加入150μl石蠟消化液,置于85oC恒溫水浴鍋孵育30min;


C、DNA提取

5. 15000g離心5min;

6. 小心吸取全部下層液體,加入375μl裂解吸附液、30μl核酸提取磁珠,置于旋轉混合儀,溫和混勻20min;

7. 用磁分離架吸附磁珠1min,棄上清;

8. 加入700μl洗滌液I洗滌磁珠,顛倒混勻洗滌1min,吸附磁珠,棄上清;

9. 再次加入700μl洗滌液I洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;

10. 加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠,棄上清;

11. 再次加入700μl洗滌液II洗滌磁珠1min,吸附磁珠;

12. 盡量吸棄上清后靜置5min,去除乙醇殘留;

13. 加入100μl洗脫液,50°C混合均勻洗脫5min;

14. 磁場吸附磁珠,回收含基因組DNA的洗脫液至另一干凈離心管內;

15. 用于后續檢測或-20℃儲存。

【自動化提取步驟(以32通道為例)】

1.DE0296B預裝板設置(96空深孔板,樣品量:15000g離心后取全部下層液體,16通量)


2.從試劑盒中取出預分裝96深孔板,輕甩96深孔板使試劑及磁珠均集中到96深孔板底部。使用前小心撕去鋁箔封口膜,避免96深孔板振動,防止液體濺出(注意:室溫低于

15℃時,請在開封使用前將96孔板置于37℃預熱20min,以避免沉淀析出);

3.在第1列、第7列中加入脫蠟消化后的全部樣本(下層液體);

4.放置2個8道磁套;根據附表所列的自動化提取程序,開始提??;客戶可按所使用的核酸自動提取儀適當調整程序,如果有問題,請聯系技術支持;

5.轉移第6列、第12列中含核酸的洗脫液,用于后續檢測或-20℃儲存。


步驟空位名稱
混合時間
(sec.)
磁吸時間
(sec.)
等待時間
(sec.)
容積
(μl)
混合速度溫度(℃)
11裂解6000070037
22吸磁30300750室溫
31結合30030070037
42洗滌1120200700室溫
53洗滌2120200700室溫
64洗滌3120200700室溫
75洗滌412030120700室溫
86洗脫30060010050
94移去磁珠3000700室溫 





1、試劑中是否還有有毒試劑?
我們的試劑不含有二甲苯等有毒試劑,可以在保護實驗室操作人的安全下快速方便的進行提取。

2、過夜消化與消化3h的差異?
過夜消化的提取效果更好,但是要是時間緊迫,3h消化液足以滿足實驗要求。

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