磁珠法體液DNA提取試劑盒
分類:體液DNA提取目錄:DE01
產品特性:
高通量:40min即可完成提取過程 |
環境安全:不含有害有機溶劑 |
抗凝劑普適:可用于各種抗凝劑 |
自動化適用:提供預裝板適配核酸自動提取儀 |
操作流程(示意圖例):
磁珠法基因組DNA提取試劑盒在胃液樣本提取幽門螺桿菌核酸的應用實例見下。
1.標本
快速尿素酶陽性(RUT+)胃液標本35例
2.試劑
①EmerTher磁珠法基因組DNA提取試劑盒;②QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN)。
3.標本核酸提取方法
胃液預處理
取1ml的胃液加入1.5ml的離心管中,加入等量的Tris緩沖液(0.67M,pH7.4),振蕩均勻,室溫放置2h。13000rpm離心5min,棄上清留沉淀。
EmerTher磁珠法基因組DNA提取試劑盒:
? 經預處理的胃液沉淀中加入700μl 裂解吸附液,混和均勻,裂解細胞6min;
? 加入30μl磁珠懸浮液,振蕩混合10min。用磁分離架吸附磁珠,棄上清;
? 加入800μl 洗滌液I 洗滌磁珠,吸附磁珠,棄上清;
? 再次加入800μl洗滌液I 洗滌磁珠,吸附磁珠,棄上清;
? 加入800μl 洗滌液II 洗滌磁珠,吸附磁珠,棄上清;
? 再次加入800μl 洗滌液II 洗滌磁珠,吸附磁珠,棄上清后靜置3-6min,去除乙醇殘留;
? 加入 100μl Nuclease-Free Water,混和均勻后洗脫5min;
? 吸附磁珠,回收含基因組DNA的洗脫液至另一離心管,進行DNA檢測及后續實驗。
QIAamp DNA Mini Kit按照說明書進行并改進,具體步驟如下:
? 在沉淀中加入180μl ATL和20μl 蛋白酶K,振蕩混勻。將離心管置于金屬浴或空氣搖床中,56°C振蕩2h;
? 從金屬浴或空氣搖床中取出離心管,進行短暫離心。在離心管中加入200μl AL,振蕩混勻;
? 離心管置于金屬浴中,70°C 振蕩10min,將離心管短暫離心;
? 在離心管中加入200μl 新鮮的無水乙醇,振蕩混勻,短暫離心;
? 將離心管中的液體全部轉入到Qiagen柱中。8000rpm離心1min,棄去廢液,保留柱子;
? 將柱子轉入到一個新的廢液收集管中,加AW1 500μl。8000rpm離心1min,棄去廢液,保留柱子;
? 將柱子轉入到一個新的廢液收集管,加AW2 500μl。13000rpm離心3min, 棄去廢液,保留柱子;
? 將柱子轉入到一個新的廢液收集管中,最高轉速離心1min。將柱子轉入到一個新的1.5ml離心管,在生物安全柜中打開蓋,晾2min;
? 在柱子中加入100μl buffer AE,蓋蓋放置5min。8000rpm離心1min,收集洗脫出的液體(含目標DNA);
? 將收集的含DNA液體重新加入柱子中,蓋上蓋子放置5min。8000rpm離心1min,收集DNA,棄去柱子;
? 將收集到的DNA分裝出2份,每份25μl。將提取到的DNA置-80℃冷凍保存。
4.結果
兩種核酸提取方法用于臨床標本檢測的比較
胃液標本35例(RUT+),分別用上述兩種提取方法抽提HP核酸模板,實驗反應體系及反應條件見上,熒光定量檢測結果如表1和圖1所示。比較兩種提取方法在測定HP特
異基因及內參基因的差別是否具有統計學意義,采用多元方差分析,Wilks’λ=0.96,F=0.73,P=0.49>0.05,結果表明兩種核酸提取方法在檢測HP特異基因及內參基因的效果相當,說明兩種提取方法在臨床標本中的檢測能力無顯著差別。
兩種核酸抽提方法,EmerTher的操作過程簡單、時間短,提取效率及臨床標本檢測能力與QIAGEN相當,在大規模臨床標本篩查時應優先選擇性價比高的提取方法。
目錄號 | 規格 | 適用機型 |
---|---|---|
DE01001 | 20份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE01002 | 100份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE01003 | 500份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE0196A | 96份 | Thermo Scientific KingFisher等多種自動磁珠純化儀 |
DE0196B | 96份 | 醫脈賽、圓點、奧盛、天隆、天根等品牌多種純化機型 |
DE0160C | 60份 | Thermo Scientific KingFisher mL等多種自動磁珠純化儀 |
DE0196D | 96份 | Thermo Scientific KingFisher Flex等多種自動磁珠純化儀 |
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【手工提取步驟】
1. 溶解蛋白酶K:按標簽所示,吸取PK溶解液至蛋白酶K干粉中配制成蛋白酶K溶液20mg/ml,顛倒混勻數次讓蛋白酶K充分溶解;
2. 取200-300μl液體樣本放入2ml離心管中,加入20μl蛋白酶K溶液、700μl裂解吸附液、30μl磁珠;
3. 置于旋轉混和儀,充分混勻30min;
4. 用磁分離架吸附磁珠1min,棄上清液;
5. 加入800μl洗滌液I洗滌磁珠,將含磁珠的洗滌液轉移至另一干凈離心管中,顛倒混勻洗滌10min,吸附磁珠,棄上清液;
6. 加入800μl洗滌液I洗滌磁珠3min,吸附磁珠,棄上清液;
7. 加入800μl洗滌液II洗滌磁珠3min,吸附磁珠,棄上清液;
8. 再次加入800μl洗滌液II洗滌磁珠3min,吸附磁珠,棄上清液后靜置5min,去除乙醇殘留;
9. 加入100μl洗脫液,60℃混合洗脫10min;
10. 磁場吸附磁珠,回收含基因組DNA的洗脫液至另一離心管,用于后續檢測或-20°C儲存。
【自動化提取步驟(以32通道為例)】
1. DE0196B預裝板設置(96孔板深孔板,樣品量200μl,16通量)
2.從試劑盒中取出預封裝96深孔板,輕甩96深孔板使試劑及磁珠均集中到96深孔板底部。使用前小心撕去鋁箔封口膜,避免96深孔板振動,防止液體濺出(注意:室溫低于
15℃時,請在使用前將96孔板置于37℃預熱20min,以避免沉淀析出);
3.在第1列、第7列中加入200μl樣本和20μl蛋白酶K溶液;
4.放置2個8道磁套;選擇附表所列的自動化提取程序,開始提??;客戶可按所使用的核算自動提取儀適當調整程序,如有問題,請聯系技術支持;
5.轉移第6列、第12列中含核酸的洗脫液,用于后續檢測或-20℃儲存。
次序 | 列號 | 程序 | 混合時間(sec.) | 磁吸時間(sec.) | 等待時間(sec.) | 體積(μL) | 混合速度 | 溫度(℃) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 裂解 | 900 | 0 | 0 | 900 | 快 | 50 |
2 | 2 | 吸磁 | 30 | 20 | 0 | 800 | 中 | 室溫 |
3 | 1 | 結合 | 600 | 30 | 0 | 900 | 快 | 50 |
4 | 2 | 洗滌1 | 600 | 20 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
5 | 3 | 洗滌2 | 240 | 20 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
6 | 4 | 洗滌3 | 180 | 20 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
7 | 5 | 洗滌4 | 180 | 30 | 120 | 800 | 快 | 室溫 |
8 | 6 | 洗脫 | 420 | 60 | 0 | 150 | 快 | 70 |
9 | 4 | 移動磁場 | 30 | 0 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
1、血液樣本基因組DNA提取方法?
答:磁珠法全血樣本基因組DNA提取通常分為兩類:
一步裂解法:將全血樣本直接加入裂解結合液后上機提??;
兩步裂解法:將全血樣本與紅細胞裂解液混合,待紅細胞細胞膜破裂后,離心收集白細胞,加入裂解結合液后上機提取。
一步裂解法適應于各種血液,包括新鮮血液、凍存血液、去血漿血細胞等,通常血液處理量為10μl到300μl;
兩步裂解法適用于白細胞結構完整的新鮮血液,通過離心后可對毫升級血液中白細胞進行富集后提取,可獲得大量基因組DNA;因操作過程涉及裂解紅細胞及離心收集白細
胞,需注意保存樣本中血細胞結構完整,過程較為繁瑣。
2、在哪些情況下選擇血液作為分子診斷DNA的來源
采用非侵入性的唾液及拭子采樣可對遺傳信息進行普通遺傳分析,在下列情況下,推薦通過血液作為樣本做為核酸來源:
1)需去除外源核酸干擾的分析,如二代測序NGS等;
2)細胞內寄生等感染性疾病檢測;
3)白細胞、造血細胞及血小板基因及變異分析;
4)臨床個性化及靶向用藥分析;
5)其他適應的條件。