本試劑盒用于全血樣本基因組DNA提取。試劑盒由高效吸附核酸的超順磁性納米微球和安全環保的提取試劑體系組成:經過獨特的表面修飾的磁珠,結合核酸能力更強;洗脫容易,使用TE緩沖液或水即可將基因組DNA從磁珠上系脫下來;操作簡單、快速,適用于基因組DNA的磁珠自動化提取過程。使用本試劑盒純化的基因組DNA可適用于各種下游操作,包括酶切、PCR、文庫構建、Southern雜交、基因測序等實驗。
操作流程(示意圖):略。
略。
目錄號 | 規格 | 適用機型 |
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DE17001 | 20份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE17002 | 100份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE17003 | 500份 | 瓶裝,適用于手工提取及Tecan、Hamilton等全自動移液工作站 |
DE1796A | 96份 | Thermo Scientific KingFisher自動純化系統 |
DE1796B | 96份 | 醫脈賽、圓點、奧盛、天隆、天根等品牌多種純化機型 |
DE1760C | 60份 | Thermo Scientific KingFisher mL磁珠提取儀 |
DE1796D | 96份 | Thermo Scientific KingFisher Flex純化系統 |
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【手動提取步驟】
1. 溶解蛋白酶K:按標簽所示,吸取PK溶解液至蛋白酶K干粉中配制成蛋白酶K溶液40mg/ml,顛倒混勻數次讓蛋白酶K充分溶解;
2. 取200-300μl全血樣本放入2ml離心管中,加入20μl蛋白酶K、700μl裂解吸附液、30μl磁珠;
3. 置于旋轉混和儀,充分混勻30min;
4. 用磁分離架吸附磁珠1min,棄上清液;
5. 加入800μl洗滌液I洗滌磁珠,將含磁珠的洗滌液轉移至另一干凈離心管中,顛倒混勻洗滌10min,吸附磁珠,棄上清液;
6. 加入800μl洗滌液II洗滌磁珠3min,吸附磁珠,棄上清液;
7. 加入800μl洗滌液III洗滌磁珠3min,吸附磁珠,棄上清液;
8. 再次加入800μl洗滌液III洗滌磁珠3min,吸附磁珠,棄上清液后靜置2min,去除乙醇殘留;
9. 加入100μl洗脫液,60℃混合洗脫10min;
10. 磁場吸附磁珠,回收含基因組DNA的洗脫液至另一離心管,用于后續檢測或-20℃儲存。
其它樣本的預處理
A. 血細胞樣本基因組DNA的提取
對分離血漿成分后的血細胞樣本進行核酸提取時,請預先用蒸餾水1:1稀釋樣本:取100μl血細胞樣本放入離心管中,加入100μl ddH2O,混合均勻。其余實驗步驟同2-10。
B. 大樣本全血基因組DNA的提取
取500μl-1000μl新鮮全血樣本放入2ml離心管中,加入1ml紅細胞裂解液(醫脈賽目錄號:CE01001或客戶自備),顛倒數次裂解紅細胞;置于離心機,350g離心10min;
棄上清,加入200μl ddH2O,混合均勻。其余實驗步驟同2-10。
【全自動提取步驟(以32通道為例)】
1. DE1796B預裝板設置(96孔深孔板,樣品量200μl,16通量)
2. 從試劑盒中取出預封裝96深孔板,輕甩96深孔板使試劑及磁珠均集中到96深孔板底部。使用前小心撕去鋁箔封口膜,避免96深孔板振動,防止液體濺出(注意:室溫低于15℃ 時,請在使用前將96孔板置于37℃ 預熱20min,以避免沉淀析出);
3. 在第1列、第7列中加入200μl樣本和20μl蛋白酶K溶液;
4. 放置2個8道磁套;選擇附表所列的自動化提取程序,開始提??;客戶可按所使用的核酸自動提取儀適當調整程序,如果有問題,請聯系技術支持;
5. 轉移第6列、第12列中含核酸的洗脫液,用于后續檢測或-20℃儲存。
次序 | 列號 | 程序 | 混合時間(sec.) | 磁吸時間(sec.) | 等待時間(sec.) | 體積(μl) | 混合速度 | 溫度(℃) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 裂解 | 900 | 0 | 0 | 900 | 快 | 50 |
2 | 2 | 吸磁 | 30 | 30 | 0 | 900 | 中 | 室溫 |
3 | 1 | 結合 | 600 | 30 | 0 | 900 | 快 | 50 |
4 | 2 | 洗滌1 | 600 | 20 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
5 | 3 | 洗滌2 | 240 | 20 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
6 | 4 | 洗滌3 | 180 | 20 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
7 | 5 | 洗滌4 | 180 | 30 | 60 | 800 | 快 | 室溫 |
8 | 6 | 洗脫 | 420 | 60 | 0 | 150 | 快 | 70 |
9 | 4 | 移動磁場 | 30 | 0 | 0 | 800 | 快 | 室溫 |
1.血液樣本基因組DNA提取方法
磁珠法全血樣本基因組DNA提取通常分為兩類:
1) 一步裂解法:將全血樣本直接加入裂解結合液后上機提??;
2) 兩步裂解法:將全血樣本與紅細胞裂解液混合,待紅細胞細胞膜破裂后,離心收集白細胞,加入裂解結合液后上機提取。
一步裂解法適應于各種血液,包括新鮮血液、凍存血液、去血漿血細胞等,通常血液處理量為10ul到300ul;
兩步裂解法適用于白細胞結構完整的新鮮血液,通過離心后可對毫升級血液中白細胞進行富集后提取,可獲得大量基因組DNA;因操作過程涉及裂解紅細胞及離心收集白細
胞,需注意保存樣本中血細胞結構完整,過程較為繁瑣。
2.在哪些情況下選擇血液作為分子診斷DNA的來源
采用非侵入性的唾液及拭子采樣可對遺傳信息進行普通遺傳分析,在下列情況下,推薦通過血液作為樣本做為核酸來源:
1) 需去除外源核酸干擾的分析,如二代測序NGS等;
2) 細胞內寄生等感染性疾病檢測;
3) 白細胞、造血細胞及血小板基因及變異分析;
4) 臨床個性化及靶向用藥分析;
5) 其他適應的條件。
3.提取當中血液顏色較深,液粘度較高,有什么方法可以盡量提取干凈?
在洗滌的時候可以充分震蕩混勻,更換新的離心管等操作,并且可以給予充足時間富集磁珠。